حجتالاسلام والمسلمین سید محمد خاتمی روز دوشنبه در پیامی نوشت: روح مطهر مرجع عظیمالشأن و فقید بزرگوار و معلم اخلاق و ادب و فضیلت حضرت آیتالله العظمی حاج آقا موسوی شبیری زنجانی به ملکوت اعلی پیوست و همه اصحاب فضل و فضیلت و بخصوص حوزههای علمیه را داغدار کرد.
رئیس دولت اصلاحات افزود: من این مصیبت بزرگ را به حضرت ولیالله الاعظم امام مهدی (ع) و به همه عالمان ربانی و فاضلان خیراندیش و به انبوه ارادتمندان و شاگردان آن بزرگ بخصوص به خاندان شریف شبیری و بالاخص به آقازادگان دانشمند و روشنبین ایشان و همه بستگان داغدار تسلیت میگویم و از پیشگاه حضرت حق میخواهم که پاداش پاکی و نیکی و خدمتگزاری آن بزرگوار به آیین و ایران و به معارف اهل بیت علیهم السلام را با علو درجات ایشان عنایت فرماید و خسارت سنگین فقدان ایشان برای اسلام و تشیع و حوزههای علمیه را با لطف ویژه خود جبران فرماید، پاک زیست و پاک بهدیدار معبود شتافت، یادش گرامی و راهش پررهرو باد!
